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■中国科学报记者 李思辉 实习生 张鸿悦
植物在漫长的适应性进化过程中,催生出丰富多元的物种谱系。这些物种既共享植物界的核心生物学特征,又各自携带独特的“遗传印记”。
“基因决定性状”是当前生命科学领域广泛认可的共识。但在进化维度上,一个关键谜题始终悬而未决:植物如何从头产生新基因,并将其成功整合进基因组,进一步塑造为“功能成熟”的基因单元,最终推动物种在进化历程中展现出差异化的表型特征?
9月2日,《细胞》在线发表了华中农业大学教授宁国贵团队的一项研究成果,该研究揭示了月季香气基因起源的新机制。这是中国科学家在《细胞》发表的第一篇关于月季研究的文章。
研究团队以月季资源为模式材料,围绕调控月季花香的一个新基因展开系统研究,揭示了自然界中全新基因从零构建的完整过程,阐明了该新基因实现表达增强的分子机制,以及其驱动表型效应产生的内在逻辑。
宁国贵(右)和博士生李亚军。张鸿悦/摄
藏在蔷薇家族中的花香“调控师”
在对不同月季资源香气特征的研究中,宁国贵团队聚焦木香花的两种香型变种,通过基因组成的精细对比,成功鉴定出一个此前未被报道的全新基因,并将其命名为SCREP。
进一步研究揭示,该基因在复杂的基因组中具备独特的“存活机制”:一旦启动表达,便能显著抑制关键芳香物质——丁香酚的生物合成,展现出对香气代谢通路的强效调控作用。
更具科学意义的是,该新基因的起源模式打破了传统认知——它并非通过错误复制旧基因、融合或拆分现有基因产生的,而是从一段原本无功能的“非编码 DNA”片段中全新演化形成。
宁国贵介绍,SCREP的形成并非一步到位,而是在进化中历经了多步骤精巧“拼装”。大约6300万年前,同为蔷薇亚科物种的树莓中首次出现了SCREP外显子片段,但当时这些片段还只是沉默的“基因积木”,未形成功能序列,无法参与生理过程。
直到约1600万年前,随着蔷薇属植物的进一步演化,这些零散的DNA片段在基因组中逐渐演变、整合与重组,最终构建出可编码蛋白质的完整基因框架,SCREP自此正式登上进化舞台,具备了发挥功能的基础结构。
仅有完整框架仍不足以使SCREP发挥强大功能。研究人员发现,一段名为MITE的“跳跃基因”插入了SCREP的启动区域,如同为其装上“能量电池”。
这一插入事件不仅使SCREP在蔷薇花中稳定表达,还助力其在蔷薇家族的繁衍中实现代代遗传,甚至在部分个体基因组中复制出多个副本,扩大了基因的作用范围。
新基因如何精准调控月季花香
据宁国贵介绍,丁香酚是多种香型月季的核心物质,其合成过程依赖4个关键酶基因的协同作用——RbCOMT1、RbCCR1、RbEGS2和RbREF1。这4个基因如同花香“生产线”上的“核心元件”,SCREP则在这条生产线上扮演“精准调度员”的角色。
一方面,它会抑制COMT、CCR、EGS这3个元件的活性;另一方面,它能激活REF1这一元件,从而精细调控丁香酚及其前体物质的积累。试验证明,SCREP的功能可整合到植物苯丙烷代谢网络,直接影响丁香酚的生物合成。
为验证SCREP基因功能在蔷薇家族中的保守性及在植物中的普遍性,研究团队进一步开展了跨物种实验:从木香花、月季、玫瑰等4种代表性蔷薇植物中提取SCREP,将其导入原本不含该基因的草莓与矮牵牛中。
结果显示,导入SCREP的草莓、矮牵牛,其体内丁香酚含量均显著降低,证明SCREP是一个功能保守的“香气开关”,可在不同植物中稳定发挥作用。
此外,在涵盖野生种、古老栽培种及现代栽培种的香气成分分析中,研究团队还发现一个规律:SCREP普遍存在于进化程度较高或经人工选育的蔷薇品种中;而那些缺少SCREP或其启动区域未插入MITE“跳跃基因”的野生及栽培种,往往能释放更多丁香酚挥发物质。
“这也表明,SCREP的有无及表达强度,正是塑造蔷薇属植物多样花香“性格”的核心因素之一。”宁国贵说。该研究不仅解答了“为什么有的花不香”的问题,更首次完整记录了一个新基因从“零”到“成熟功能基因”的全过程,清晰呈现了基因起源的特殊路径。
相关专家表示,这一研究成果为科研人员重新理解新基因的形成机制、功能进化路径及表型分化机制提供了理论依据,也为从头设计并合成具备特定功能的全新基因提供了新思路。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.08.011
《中国科学报》 (2025-09-05 第1版 要闻)